Возможно, в вашем кабеле и разъемах нет ничего плохого, так как вначале вентилятор работает недолго. Если вы все равно хотите приложить усилия, переустановите разъемы на обоих концах кабеля вентилятора.
Посмотрите на настройки BIOS, чтобы увидеть, что доступно в способе управления вентилятором, если что-нибудь.
Процессор, скорее всего, имеет термометр и может варьировать скорость вращения вентилятора. Если процессор не горячий, ему не нужно запускать вентилятор на высокой скорости. Возможно, ваша плата была разработана, чтобы не запускать вентилятор вообще ниже определенной температуры процессора.