GTK в первую очередь выполняет рендеринг на стороне клиента. Для вас это означает, что любые темы, которые вы хотите использовать, должны быть в удаленной системе (системе, в которой запущено приложение GTK).
После того, как вы установили тему на окно linux, вы можете заставить ее использовать приложения GTK, изменив файл .gtkrc-2.0 (опять же, на окне linux), создав этот файл и добавив строку, подобную этой:
include "/usr/local/share/themes/Raleigh/gtk-2.0/gtkrc"