Карта PCIe2.0 будет работать только на PCIe2.0, даже если вы используете слот PCIe3.0
Кроме того, вам нужен процессор Ivy Bridge, чтобы использовать PCIe3.0
Даже если 3,0 = 2x2,0, это на основе полосы
Пропускная способность не будет перераспределена между большим количеством полос, как вы ожидаете
Кроме того, разница в производительности должна быть минимальной между 8x / 8x и 16x / 16x, поэтому я сомневаюсь, что вы должны волноваться из-за этого